合伙企業是指由各合伙人訂立合伙協議，共同出資，共同經營，共享有收益，共擔風險，并對企業債務承擔無限連帶責任的營利性組織，又可分為普通合伙企業和有限合伙企業。

1、合伙企業增值稅

根據合伙企業的正常業務類型，區分不同的稅率和征收率正常繳納，正常對外開具增值稅發票即可，和其他企業并無不同。

2、合伙企業所得稅

合伙制企業本身并不具有法人地位，不屬于企業所得稅納稅主體，自身并不需要繳納企業所得稅，由合伙人繳稅。

根據財稅[2000]91號文，合伙企業以每一個合伙人為納稅義務人。

對合伙企業而言，被穿透的只是所得稅。

對于流轉稅而言，合伙企業仍然是納稅主體。財稅[2016]36號文第一條規定，“在中華人民共和國境內銷售服務、無形資產或者不動產(以下稱應稅行為)的單位和個人，應當按照本辦法繳納增值稅。”因此合伙企業屬于增值稅的納稅主體，其生產經營所得應對照適用稅率繳納增值稅。

從事股權投資的有限合伙企業，股權轉讓所得不需要繳納增值稅，但企業在二級市場出售股票的行為，應比照國家稅務總局2016年第53號公告第五條對限售股買入價格的判定標準，按照“金融商品轉讓”品目繳納增值稅。

股息紅利并入生產經營所得繳稅

對于合伙企業取得的生產經營所得，財稅[2000]91號文規定，按照每一納稅年度的收入總額減除成本、費用以及損失后的余額，作為投資者個人的生產經營所得，適用5％—35％的五級超額累進稅率，計算征收個人所得稅。但對于合伙企業對外投資取得的股息紅利所得，不并入企業的收入，應作為合伙人取得的股息紅利，單獨納稅。合伙人為自然人，“按‘利息、股息、紅利所得’應稅項目計算繳納個人所得稅”（國稅函[2001]84號）；合伙人為法人，取得的股息紅利由于不屬于“居民企業直接投資于其他居民企業取得的投資收益”，因此不能享受居民企業之間的股息紅利免征企業所得稅政策，應并入法人合伙人當期應納稅所得額，按25%繳納企業所得稅。

3、合伙人所得稅

對合伙企業生產經營所得和其他所得，應按“先分后稅”原則征收所得稅，以每一合伙人為納稅人，分別繳納個人所得稅或企業所得稅。自然人合伙人繳納個人所得稅，法人或者其他機構繳納企業所得稅。

《財政部、國家稅務總局關于合伙企業合伙人所得稅問題的通知》(財稅[2008]159號)規定合伙企業以每一個合伙人為納稅義務人。合伙企業合伙人是自然人的，繳納個人所得稅;合伙人是法人和其他組織的，繳納企業所得稅。

有限合伙企業合伙人：

股東為自然人承擔個人所得稅：根據財稅[2000]91號文，合伙企業比照個人所得稅法的“個體工商戶的生產經營所得”應稅項目，適用5％—35％的五級超額累進稅率計算征收個人所得稅。

備注：執行有限合伙企業合伙事務的自然人普通合伙人，按“個體工商戶的生產經營所得”應稅項目，適用5%-35%的五級超額累進稅率，計算征收個人所得稅。不執行有限合伙企業合伙事務的自然人有限合伙人，其從有限合伙企業取得的股權投資收益，按“利息、股息、紅利所得”應稅項目，依20%稅率計算繳納個人所得稅（以地方執行政策為準）。因此符合條件的有限合伙企業，自然人有限合伙人可以享受20%優惠稅率，自然人普通合伙人，仍然適用五級超額累進稅率計算繳納個人所得稅。

股東為企業承擔企業所得稅：合伙人是法人組織的情況，按照企業所得稅來繳納，適用25%的稅率。

疑點1：如果合伙企業的利潤留存在企業，一直不作分配，合伙人需不需要繳稅？

財稅[2008]159號文規定：“合伙企業生產經營所得和其他所得采取‘先分后稅’的原則”。“先分后稅”：“先分”是指“應分配”的所得，而不是實際分配的金額。合伙企業的應納稅所得額中不僅包含分配給合伙人的利潤，也包括應分而未分的留存收益。因此，即使合伙企業對其利潤未做分配，也應該按照稅法規定的分配比例，計算每個合伙人的應納稅所得額。（這個是與有限公司不同的地方，有限公司是有分紅才納稅，不分紅不納稅，因為有限公司分紅的那部分是已經繳納過企業所得稅的，而合伙企業用于分配的利潤還沒有繳納所得稅。）

疑點2：合伙企業虧損如何處理？

合伙企業虧損了，是否也可以享受有限公司那種虧損可以稅前彌補的政策，得區分兩種情形，一個是法人投資者，一個是個人投資者。法人投資者，還是159號文的規定，合伙企業的合伙人是法人和其他組織的，合伙人在計算其繳納企業所得稅時，這部分投資損失是不能當時就跨企業抵扣的，而是要等到這家被投資的合伙企業以后盈利了，用虧損來抵減盈利，用這種方式來體現當時沒有調整的投資損失。當然如果合伙企業虧損的當年就關門清算了，那法人的股權投資損失是可以稅前抵扣的。

對于合伙企業，無論投資者是個人還是法人，適用的政策與一般企業相同，只是對于法人投資者而言，合伙企業的虧損不能當時跨企業抵減。